廉政署與調查局係屬夥伴關係，二者為法務部的左右手；未來在肅貪工作方面，將以分進合擊、交叉火網之方式，共同打擊貪腐，降低貪瀆犯罪率。將來廉政署專責偵辦公部門的貪瀆案件，但不獨占，與調查局明確且適當的分工配合，在檢察官統合、指揮下，形成「交叉火網」，發揮複式布網功能，進而減低犯罪死角。
廉政署首創「派駐檢察官」機制，建立檢察官「先期介入」偵查之期前辦案模式。由各地檢署派駐檢察官於廉政署，指揮廉政官及相關司法警察（官）偵辦貪瀆案件，係以多重過濾查證機制，精準掌握犯罪事證，於兼顧法院組織法、刑事訴訟法之檢察一體、偵查不公開等規定，秉持案件不分大小、公開透明、不論層級，事證明確一律嚴辦等原則實施偵查，強化貪瀆案件偵辦效能，精緻偵查作為提昇定罪率，不會發生有濫行起訴之情形，並藉以落實保障人權。
更新日期：Sep 22, 2011